来，以供部队外出使用。只有核心分子才能在驻地外招出组织主旗。如若一只战队有了组织主旗，那么就可以断定有核心分子在内。
驻地主旗可自行对倾入者攻击，而被招出来的主旗，则是只能由核心分子控制进行攻击，并且一旦有一个核心分子招出了主旗，那在其他地区的核心分子就不能再招一面出来，且在驻地内不能招出。
正式组织的战旗，跟非正式组织差别很大，这不仅体现在制造源上，更主要是棋手的区别。正式组织，无论是主旗还是下属部队战旗，棋手都由充当，一旦招出，会有自动执旗。
非正式组织，旗帜是玩家自行制造的，而正式组织，旗帜是天机池制造的。目前，神农联盟拥有制造二等旗帜权限，总共六种型号的旗帜。一等就是组织主旗，只能设定一种型号，二等是二级、三级机构标识旗。
按照联盟的机构设置，剔除了必须的主旗外，这剩下来的旗帜名额该给五大总署，不过几位核心分子经过商议后，决定先给战斗旗队设旗，因为纯战斗部队外出比较频繁，没个战旗说不过去，联盟脸面无光彩。
神农联盟共有五大旗队，正好五个型号配一个旗队，如武当旗队，就用了其中一个名额。联盟未正式建立前，按照某人的提议，武当称为集团军，下属三个师，每个师都有自己的战旗。
但联盟建立后，会阴、摩天、武当三集团军撤销，各属人员并入各机构，如此那些玩家制造的旗帜就无用了。武当三个师的土造战旗被各自的指挥官收藏，当作纪念品存入了自己的库藏。
对于那三个家伙没了自己的特属战旗，方大首席觉得还是很高兴的，因为这
十二回 组织战旗，清洗屠杀(2/11)