另外，石达开展现出了超人的政治才能。1853年秋，石达开奉命出镇安庆。过去，太平天国没有基层政府，地方行政一片空白，石达开到安徽后，很快组织各地人民登记户口，选举基层官吏，又开科举试，招揽人才，建立起省、郡、县三级地方行政体系，使太平天国真正具备了国家的规模；与此同时，整肃军纪，恢复治安，赈济贫困，慰问疾苦，使士农工商各安其业，并制定税法，征收税赋，为太平天国的政治、军事活动提供所需物资。
当天王洪秀全下令捉拿石达开时，他给自己留了一条后路，暗中派人四处散布消息，说这圣旨是韦昌辉逼迫天王下的。
于是，天国举**民拿着捉拿悬赏石达开的圣旨当草纸，以为天王也是受了北王的蒙蔽。太平军各地的高级军队将领，比如陈玉成，李秀成也纷纷表态支持翼王石达开。
就在这时，清军进攻宁国，陈玉成部十分危急，石达开以大局为重，先去退清兵，他的威望在天国达到最高点。
而也就在石达开率部赶赴宁国援助陈玉成部的前后，石达开再次向天王洪秀全发出通牒，再次公开要求天王杀韦昌辉这个刽子手，以顺民心，并称如若不然，将提靖难之师打回天京以清君侧。