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而与海军部并列的海军参谋部则下辖
军务司、作战司、情报司、通信司、作训司五大部门，
军务司负责庶务、军务管理，作战司负责舰队编制、作战计划的制定与实行、军纪节制等事务，是海军参谋总部的核心部门，
情报司负责军事情报搜集，作战海域航道、天气等情况侦查，战史与外国情报翻译。
通信和作训司分别负责舰队与本土、海军基地的联系，以及海军舰艇人员、后备人员的训练与选拔等事务。
海军参谋本部与海军部的设立，即意味着两部主官军事权力的缩小，同时职能再次细分与完善后，无论是海军部还是海军参谋本部的行政地位都得到大幅度的提高，
在原有的总参谋部制度下，虽然海军和陆军并列为总参谋部的下属单位，但是总参谋部下面各司局级单位百分之七十以上被陆军军官占据，海军在里面的发言权受到极大的限制与压缩。这一点从陆海军双方的将级军官数量上面很容易能够看出区别，
陆军方面，七个野战部队师长、禁卫师师长全部是少将级或者中将级军官，而海军方面，将级以上军官只有陈森、李汉两人，且级别都是少将，将级以下的主要军官只有冯国安、候泰元两人，无论是在将级军官还是校级军官的数量上，海军与陆军的差距都在四倍以上。
海军建立时间比陆军稍晚，战略地位比之陆军也有不小差距，种种原因综合在一起，导致了陆海军力量的失衡，不过，随着海军机构重组的机会，陈森、李汉两人看到了海军崛起的机会，而候泰元、冯国安在欣喜海军得到皇帝和政府重视的同时，也
第三百七十三章 海军机构重组(2/5)