院博士推出去宣武门车裂于菜市口，还让南北镇抚司锦衣卫队抓捕方家十族斩首。
7月17日朝中内外无人反对的情况下，明燕武亲王开始在奉天殿内登基加冕，又去太庙祭祀称帝，改次年为〈永乐〉史称「明太宗」他还下令大力搜索明兵部尚书：齐泰、明翰林院大学士：黄子澄，等建文朝臣五十余人，还废除了建文年间所改的一切太祖皇帝制定的成法和官制，以表明其起兵目的在于恢复祖训。
明永乐元年公元1403年，明太宗：朱棣，下令安抚被明惠宗削藩以及受靖难之役影响的藩王们以稳定国内局势，还表示自己和皇侄子明惠宗不同，先后恢复了明周定亲王：朱橚、明代简亲王：朱桂、明岷庄亲王：朱楩，等诸亲王旧封。
其中明惠宗的皇三弟明吴悼亲王：朱允熥、皇四弟明衡憨亲王：朱允熞、皇五弟明徐简亲王：朱允熙，三人尚未就藩就被明太宗给降封为郡王（明广泽郡王：朱允熥、明怀恩郡王：朱允熞、明敷惠郡王：朱允熙）并以不能匡正明惠宗为由废除三位郡王为庶人，软禁明广泽郡王与明怀恩郡王两人于中都留守司凤阳府英武卫，仅留明敷惠郡王一人独自奉祀明懿文皇太子灵位。