宠的你是说绫波丽，你们的关系已经好到能够互发短信的地步了吗，可喜可贺，可喜可贺。”零观笑道。
“我们的关系可没有好到那个程度。”明日香双手抱胸，不爽的说道，“我只不过是为了驾驶eva，dǐng替了驾驶三号机进行一次实验而已，她就多礼的向我发了一条道谢的短信。真实的，肯定是受了那个笨蛋的影响。”
“呵呵”零观轻轻笑了笑，心中忖道：三号机原来如此，也就是说，第九使徒已经来了。
在剧中，第九使徒的入侵可说是非常有名的大事。
明日香驾驶三号机在松代实验场进行实验，结果事先侵蚀进入三号机的第九使徒趁机入侵，篡夺了三号机的控制权，从实验场地径直前往nerv本部。随后，碇源渡派遣搭载傀儡系统的初号机迎战。
因为知道三号机里面也有驾驶者，碇真嗣无法出手，碇源渡遂命令启动傀儡系统，被强行管制的初号机以暴力的战斗方式将三号机分尸并捕食，承载驾驶员明日香的插入栓也被当场咬碎。
目睹这个场景的真嗣对自己杀了人感到非常悔恨，后来知道驾驶员就是明日香的时候这时候的他以为明日香死了，开着初号机威胁并踩踏nerv本部直到lcl浓度升高，初号机停摆为止。
第九使徒的这次入侵，把刚刚有希望从绝望中走出来的碇真嗣重新打入绝望的深谷，让他知道了“大人”和“现实”的残酷。同时，碇源渡的残忍、冷血，为达目的不择手段也在这里更进一步的表现出来。
这虐明日香的一幕被一众宅男视为eva众多经典画面之一。
现在，明日香已经代替绫波丽接下了驾驶三
62.三号机到来(5/6)