被捕入狱，1794年回到海军服役，组织过1796年的爱尔兰远征，1797年晋升海军少将。1789到1799年间任海军部长，在任期间他全力以赴地集中财力建造了16艘炮舰和18艘驱逐舰，主要目的是重建法国海军以保卫法国海岸和法国的利益。1799年他晋升为海军中将。
这位旧学校培养出来的文雅绅士，不害怕说出自己的想法。当德克里斯在拿破仑登上第一执政的宝座时问他送什么“捐赠”以及他认为这个伟人应该穿什么衣服时，布律克斯大声斥责道：“让他什么也别穿，这样你吻他p股时不是更加方便了吗！”德克里斯从此再也不敢问这类问题了。尽管这位海军中将x格有些独立不羁，拿破仑还是任命他为国家舰队司令，除了拿破仑喜欢他的其他原因外，很重要的是布律克斯曾经支持过拿破仑的雾月政变——拿破仑很少忘记他的政治和军事义务。
1803年7月30r，第一执政拿破仑正式宣布开始建造入侵英国的“国家舰队”，但直到两个月后，他才命令布律克斯和富法特制定详细的入侵计划，包括需要的船只数量。事实上，拿破仑在没有计划和蓝图的情况下已经订造了成百上千艘船只，他计划运送11万多人（不包括海军的人员）和7；000匹战马，这些数字在今后可能进一步增加。为了运送这些队伍和马匹，需要建造平底炮舰和驳船等4种不同类型的船只；但现在所有的船都是平底的、无龙骨的，最大的三桅平底炮舰总长110英尺，可以输送120名士兵和一些马匹。单层甲板上装着12门24磅的大炮。较小的驳船理论上只能载70多人和几门榴弹炮。多数这类船都不适合海上航行，但是拿破仑没有对
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