帅也发生了严重的分歧。
在奥斯特里茨战役中也许最严重的不和，要算冷漠、高傲、无情的苏尔特和鲁莽的拉纳之间的矛盾了。在布尔诺，好心但容易冲动的拉纳甚至向苏尔特提出决斗，仍然是被拿破仑拦了下来。在战役结束后，拉纳激烈地攻击拿破仑没有充分肯定他对这次大捷的重要贡献。拉纳是对的；拿破仑的确没有表扬他，没有在《陆军公报》上给他以应有的评价，拿破仑历来对别人的贡献是视而不见的。后来，拿破仑和拉纳之间甚至发生了更加严重的失和，给他们之间的亲密关系留下了永久的创痕。
换句话说，在这次战役中，身在维也纳及其附近的5名战地元帅，在他们即将北渡多瑙河、在摩拉维亚平原的奥斯特里茨村和俄军决战之前，相互已经或即将成为充满敌意的对头，从而使他们不能同心协力对付外国军队。在将来的战役中，这些敌意仍然不会消失，结果导致一次次悲剧的结局。
然而，说到底，拿破仑本来就对缪拉不满，深层的原因无疑是缪拉曾经和约瑟芬睡过觉；加上他在这次战役中屡屡违背拿破仑的意图、放跑库图佐夫，贻误了战机，拿破仑对他自然更加不满。几天之后，法军向沙皇亚历山大的军队近，内伊全力追击库图佐夫；巴格拉吉昂7亲王顽强据守奥博霍拉布鲁恩，掩护库图佐夫撤退。俄国将军维茨格罗德向缪拉提出了休战的要求，缪拉竟愚蠢地同意了；这样不仅使库图佐夫得以顺利逃脱，而且和沙皇亚历山大的兵力会合，这正是拿破仑竭尽全力想要避免发生的事。“我完全无话可说了！”11月16r，拿破仑对缪拉嚷道，“立即撕毁休战协议，去进攻敌人！前进！摧毁俄军！”但此时已经太晚了
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