此次海战荷军以旗舰“因克号”为首的五艘战舰被击沉，三艘战舰被俘。另有“安妮号”等二艘战舰受重创后逃逸。而义勇军舰队除“飞虎号”受伤较重外没有一条战舰损失。义勇军以完美的队型以及默契的配合再次震撼了整个亚洲海域。由于义勇军的这种战术是在旗舰的指挥下通过海军信号系统实施的机动作战。十分类似于草原上狼群在头狼带领下的进攻方式。这也为义勇军海军博得了“海狼”的称号。而李海“东亚狼”的绰号更是传遍了各个大洋。
至于那两艘逃逸的战舰。其中一艘在回巴达维亚的途中遭遇暴风雨沉没了。另一艘“安尼号”则在穿过暴风雨之后踉踉跄跄的回到了巴达维亚。并将整场海战的过程告诉了巴达维亚当局。荷兰殖民者在得到这个消息之后惊恐万分。生怕明军会趁势攻打巴达维亚。便有人提出要屠杀当地华人以防到时候当地华人与明军勾结。不过这个提议很快就被否决了。以现在这种情况屠杀当地华人必将引起明军疯狂的报复。想到这些就让荷兰殖民者异常的恐慌。于是巴达维亚决定封锁海域，禁止华人船只出港以防明军的攻击。至于台湾嘛。此时的荷兰人已经没这个精力去管台湾了。
事后“安尼号”船长奥波托在给荷兰当局的报告中这样评价厦门海战：“这些东方人发明了新的海上战术理论、海战实践和一套新的信号系统，促使海战从‘战列线’向‘机动战术’的转变。可以预见从此海战将由单舰格斗发展为以炮战为主的纵队攻击；夺取制海权已成为海军的主要战略任务。不得不承认中国人在海军发展方面走到了欧洲各国的前面……”不过奥波托的这份报告并没引起荷兰军方的重视。在他们看来奥波托船
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