当年伏羲琴最早，是掌握在伏羲和女娲的手里的。
伏羲和女娲本是兄妹，可是世上只有他两个人，为了繁衍人类，他们向苍天祈求说，若是能让他们两个人在一起的话，就天上的白云聚集在一起，他们两个人就结为夫妻，若是天上万里无云的话，他们两个人就只做兄妹。
结果等他们跪拜天地之后，天上的云全部都聚在一起，所以他们两个人结为夫妻。
伏羲为女娲做了一把伏羲琴，送给女娲当做订情物，这把琴就跟随他传了下来，到了后期黄帝出现，女娲伏羲消失不见，只留下了这把伏羲琴，而这琴则被当时征服整个部落的黄帝得到，他死后这把琴应该在他的墓中。